Schema for snp150ExceptionDesc
  Database: hg38    Primary Table: snp150ExceptionDesc    Row Count: 22   Data last updated: 2020-06-15
fieldexampleSQL type info
exception RefAlleleMismatchvarchar(63) values
count 133int(10) unsigned range
description The reference allele from d...varchar(255) values

Connected Tables and Joining Fields
        hg38.snp150.exceptions (via snp150ExceptionDesc.exception)
      hg38.snp150Common.exceptions (via snp150ExceptionDesc.exception)
      hg38.snp150Flagged.exceptions (via snp150ExceptionDesc.exception)
      hg38.snp150Mult.exceptions (via snp150ExceptionDesc.exception)

Sample Rows
 
exceptioncountdescription
RefAlleleMismatch133The reference allele from dbSNP does not match the UCSC reference allele.
RefAlleleRevComp0The reference allele from dbSNP matches the reverse complement of the UCSC reference allele.
DuplicateObserved871633There are other rsIds at this position with identical variation.
MixedObserved8012609There are other rsIds at this position with different variation.
FlankMismatchGenomeLonger73619NCBI's alignment of the flanking sequences had at least one mismatch or gap.  (UCSC's re-alignment of flanking sequences to the ...
FlankMismatchGenomeEqual231117NCBI's alignment of the flanking sequences had at least one mismatch or gap.  (UCSC's re-alignment of flanking sequences to the ...
FlankMismatchGenomeShorter170412NCBI's alignment of the flanking sequences had at least one mismatch or gap.  (UCSC's re-alignment of flanking sequences to the ...
NamedDeletionZeroSpan309A deletion (from the genome) was observed but the annotation spans 0 bases.  (UCSC's re-alignment of flanking sequences to the g ...
NamedInsertionNonzeroSpan237An insertion (into the genome) was observed but the annotation spans more than 0 bases.  (UCSC's re-alignment of flanking sequen ...
SingleClassLongerSpan69464All observed alleles are single-base, but the annotation spans more than 1 base.  (UCSC's re-alignment of flanking sequences to ...

Note: all start coordinates in our database are 0-based, not 1-based. See explanation here.